智能审计依赖于海量的审计大数据。这些大数据不仅存在于被审计单位，可能还涉及与被审计单位有业务关联的外部单位数据。这些数据有的是涉及商业机密或隐私的敏感数据，其“被审计”是否符合商业道德？另一方面，由于智能审计系统内部算法的不透明，一旦出现审计错误，究竟是审计人员承担责任，还是审计系统承担责任，若是审计系统责任，又由谁具体承担，责任主体很难界定。这些伦理风险若不解决，智能审计就无法深入。